A Treviglio la S6 si attesterà alla stazione Centrale, dove fermano anche la Milano-Brescia e la Bergamo-Cremona.
Manca corrispondenza con la Milano-Bergamo, che ferma alla stazione Ovest.
Si potrebbe quindi realizzare un binario unico indipendente da Centrale a Ovest. La S6 arriverebbe a Centrale, farebbe rapidissima inversione di banco e finirebbe la sua corsa alla stazione Ovest.