Trasporti a Milano

Quindi la soluzione opposta, giudicando (a torto o a ragione) che i costi della compatibilità non valevano i vantaggi della compatibilità stessa.

Esatto.
Purtroppo non si è nemmeno scelta la compatibilità con la S-Bahn di Berlino, e nemmeno con le metropolitane a sagoma larga

A proposito, wikipedia in inglese ripoirta che la S-Bahn di Amburgo condivide alcune tratte con servizi regionali e merci, quindi probabilmente la non compatibilità è riferitaa lle tratte centrali e non ai rami esterni

Sì, è un ampliamento recente, della linea S3 fino a Stade.
È una linea locale con un certo traffico merci, in cui la costruzione di un binario separato per la S-Bahn sarebbe stato antieconomico.
Il servizio su questa linea avviene con mezzi ibridi appositamente progettati, che hanno la presa di corrente a terza rotaia ma anche da linea aerea, ovviamente a due diverse tensioni di alimentazione.

Non ho capito la faccina di S-Bahn.

Entrando nel dettaglio tecnico in cosa consiste l'incompatibilità? Sagoma in altezza (gallerie troppo basse?)

Quello di certo.
Per il resto non saprei: a Berlino differiscono anche la larghezza, il raggio minimo e la pendenza massima percorribili.

A Milano, una delle poche cose forse fattibili sarebbe stata la confluenza della Abbiategrasso-Milano Porta Genova nella M2 (previa costruzione di un nuovo ramo ferroviario Abbiategrasso-Magenta, per instradarvi - via la Torino-Milano storica - la linea di Mortara-Vigevano); insomma, trasformare in diramazione della M2 la vecchia linea di Mortara, nel suo tratto più suburbano (anche se così si sarebbe declassata la cintura sud): ormai non più realizzabile, né ovviamente auspicabile (vedi l'ottima S9)...

Ecco gli elettotreni bimodali della S-Bahn di Amburgo (serie 474.3).
La linea per Stade è servita dalla S-Bahn dal 2007.

A Londra la linea "Metropolitan" della metropolitana corre in gran parte in superficie sulle linee ferroviarie nazionali.
Tuttavia non si tratta di una linea a tubo, bensì di una linea a sagoma ferroviaria (anzi: nata proprio come penetrazione ferroviaria urbana), quindi senza particolari problemi.

In pratica a Londra c'è la Tube e poi ci sono le Suburbane, che continuano a chiamare metro.

I nomi dipendono in parte dalle caratteristiche tecniche, in parte da ragioni storiche, in parte dalla società esercente.
Ad esempio fra le suburbane è nota la Overground, ma esistono molti altri servizi dal nome meno attrattivo, ma di qualità anche superiore. Davanti alla cattedrale di San Paolo passa addirittura un passante ferroviario che non è segnato sulle mappe della metropolitana...

Davvero? Si può sapere quali sono a grandi linee le categorie londinese del Tpl?
C'é l'underground, l'overground, il tramlink, the buses e ...

C'è un gran numero di treni regionali con nomi commerciali di ogni tipo, che cambiano nel tempo.